Đánh giá đa dạng di truyền quần thể

Đánh giá đa dạng di truyền quần thể các đàn cá vật liệu đầu vào của các chương trình di truyền chọn giống đã và đang được thực hiện ngày càng nhiều trong lĩnh vực nuôi trồng thủy sản trên thế giới. Trong nghiên cứu này, 3 nhóm mẫu cá gồm cá tự nhiên 1 (30 cá thể), tự nhiên 2 (30 cá thể) và nhóm cá từ chương trình chọn giống của Viện (88 cá thể) đã được sử dụng cho nghiên cứu. Mẫu vây cá được thu, lưu trữ trông cồn, và tách chiết DNA tổng số. Sử dụng 10 Microsatellite đã được sàng lọc và tối ưu hóa các qui trình PCR tương ứng để đánh giá đa dạng di truyền của các mẫu. Các sản phẩm PCR được điện di và đọc kết quả bằng máy điện di mao quản QIAxcel Advanced (QIAGEN Group). Có 1480 phẩm PCR được đọc và truy suất ra hình ảnh và kích cỡ sản phẩm PCR bằng phần mềm QIAxcel ScreenGel phiên bản 1.2.0. Dữ liệu đầu ra sẽ được đưa vào bảng Excel, tinh lọc và mã hóa tương thích cho các phần mềm phân tích di truyền quần thể, phần mềm GENETIX và GENEPOP. Phân tích đa dạng di truyền bao gồm đa dạng di truyền bên trong mỗi quần đàn, tính cân bằng theo định luật Hardy–Weinberg, tính mất cân bằng liên kết, sự khác biệt di truyền, khoảng cách di truyền và mức trao đổi gen giữa các quần đàn cá đã. Kết quả cho thấy mức độ đa dạng di truyền cao và tương đối giống nhau ở cả hai cấp độ của dị hợp tử và số alen. Không có sự khác biệt và phân ly di truyền giữa các quần đàn cá. Mức độ trao đổi gen giữa các quần đàn khá cao và khoảng cách di truyền giữa các quần đàn là khá gần.

Kết quả (Anh) 1:

Evaluation of genetic diversity of fish populations of the input materials of the genetic program of choice has been and is being implemented more and more in the field of aquaculture around the world. In this study, three groups of fish samples include natural fish 1 (30 individuals), natural 2 (30 individuals) and fish from the same selection program of the Institute (88 individuals) were used for the study. Fish fin samples are collected, stored, and DNA extraction dunes look total. Use 10 Microsatellite was screening and optimization of the PCR process respectively to assess the genetic diversity of the samples. The PCR products are portable and read results by electrophoresis machine management Advanced QIAxcel mao (QIAGEN Group). There are 1480 visitors read and PCR products output images and PCR product size by QIAxcel software ScreenGel version 1.2.0. The output data will be put into Excel table, filtered and compatible encryption software for genetic analysis of populations and GENETIX GENEPOP software,. Analysis of genetic diversity includes genetic diversity within each herd populations, balance according to the law of Hardy-Weinberg, computer link imbalance, genetic differentiation, genetic distance and the level of the exchange of genes between populations was fish. The results showed high levels of genetic diversity and relatively the same in both levels of heterozygous alleles and the number. No the difference and genetic disconnection between the fish populations. The level of the exchange of genes between the Forum and the genetic distance between the forums is quite near.

Kết quả (Anh) 2:

Assessment of genetic diversity of fish populations input materials of the genetic breeding programs already being implemented more and more in the field of aquaculture in the world. In this study, three groups of specimens including wild fish 1 (30 instances), Natural 2 (30 individuals) and groups of fish from the breeding program of the Institute (88 individuals) was used for research . Samples were collected fins, stored in alcohol, and total DNA extraction. Using 10 microsatellites were screened and optimized processes corresponding PCR to assess the genetic diversity of the sample. The PCR products are electrophoresis results and read by machine QIAxcel Advanced capillary electrophoresis (QIAGEN Group). There are 1480 PCR read and access the images and the size of the PCR products with software version 1.2.0 QIAxcel ScreenGel. Output data will be incorporated into an Excel table, refined and compatible encryption software for population genetic analysis, software and GENEPOP Genetix. Analysis of genetic diversity including genetic diversity within each colony, the balance Hardy-Weinberg's law, compute link imbalance, genetic differences, genetic distance and genetic exchange rate among fish populations. Results showed that the level of genetic diversity high and similar in both levels of heterozygosity and number of alleles. No differences and genetic segregation between populations of fish. The degree of genetic exchange between populations is high and the genetic distance between populations was close.