Việc định danh mẫu dựa trên phương

Việc định danh mẫu dựa trên phương pháp trình tự tương đồng đã tiến hành trên cơ sở dữ liệu GenBank. Trình tự DNA được so sánh và phân tích độ tương đồng với các trình tự trong ngân hàng gen quốc tế bằng cách sử dụng phần mềm BLAST. Dữ liệu trình tự COI của mẫu phân tích và dữ liệu có sẵn trong ngân hàng gen sẽ được chuẩn bị để phân tích khoảng các di truyền giữa các mẫu bằng cách sử dụng phần mềm MEGA phiên bản 6.0 (Tamura và ctv, 2007). Sử dụng phương pháp Neighbour-joining (NJ) và mô hình khoảng cách Kimura 2-Parameter (K2P) (Kimura, 1980) có trong phần mềm MEGA để xây dựng cây phát sinh chủng loại của COI. Với bộ dữ liệu gốc, bootstrap 1000 lần được thực hiện nhằm đánh giá độ tin cậy của sự phân nhánh trên các cây phát sinh chủng loại NJ.

Kết quả (Anh) 1:

The model identification based on the method of sequence similarity has conducted on the GenBank database. DNA sequences were compared and analyzed the similarities with the sequences in the international gene bank by using the BLAST software. COI sequence data of the sample analysis and data available within the gene bank will be prepared to analyze about the genetics between the samples using the MEGA software version 6.0 (Tamura et al., 2007). Using the Neighbour-joining (NJ) and gap model Kimura 2-Parameter (K2P) (Kimura 1980) included in the MEGA software to construct phylogenetic tree kind of TREAT. With the original data, 1000 times the bootstrap is performed in order to evaluate the reliability of the branching on the phylogenetic tree type NJ.

Kết quả (Anh) 2:

The sample identification method based on sequence similarity was conducted on the GenBank database. DNA sequences were compared and analyzed similarity to sequences in the international gene banks using BLAST software. COI sequence data of sample analysis and data available in the gene bank will be prepared to analyze genetic around the middle of the sample using MEGA version 6.0 software (Tamura et al, 2007). Using Neighbour-Joining (NJ) and model Kimura 2-parameter distance (K2P) (Kimura, 1980) with the MEGA software to build Phylogenetic tree of COI. With the original data, bootstrap 1000 was conducted to assess the reliability of the branch on the phylogenetic tree NJ.