Phân tích phả hệ và quan hệ di truy

Phân tích phả hệ và quan hệ di truyền giữa các nhóm vây ngắn, trung bình và dài
Các trình tự gen COI của 45 mẫu cá chim vây vàng thuộc 3 nhóm vây ngắn, trung bình, dài và trình tự của Trachinotus ovantus,Trachinotus blochii được lấy trên ngân hàng gen với mã số lần lượt là HQ127346 và KJ184305. Sau khi phân tích bằng phần mềm chuyên dụng MEGA 6 theo phương pháp NJ (Neighbor-Joining), trên cơ sở giả định các đặc điểm biến đổi có giá trị ngang nhau, khoảng cách tiến hóa theo mô hình Kimura 2 tham số, giá trị bootstrap 1000 lần lặp lại và các thông số khác mặc định, kết quả được thể hiện ở hình 4.
Thứ tự phân nhánh của cây phân loài NJ cho thấy các mẫu trong thí nghiệm này có thể chia làm 2 nhánh lớn khác biệt rõ rệt (Hình 6)
Nhánh I: gồm các mẫu vây ngắn và vây trung bình được kí hiệu N1, N2...N15; TB1, TB2, TB3...TB15 và Trachinotus ovantus
Nhánh II: gồm các mẫu vây dài được kí hiệu D1, D2..D15 và Trachinotus blochii.

Kết quả (Anh) 1:

Pedigree analysis and genetic relationships among groups of short, medium and long finThe COI gene sequences of 45 samples of yellow fin Angelfish fin Group 3 in short, medium, long and the sequence of Trachinotus blochii, Trachinotus ovantus be retrieved on the gene bank with code KJ184305 and HQ127346 respectively. After analysis by the dedicated software MEGA 6 by the method of NJ (Neighbor-Joining), on the basis of the assumption that change together, about how evolution model Kimura 2 parameters, the value of 1000 bootstrap repetitions and other parameters by default, results are shown in Figure 4. The order of branching tree subspecies NJ showed patterns in this experiment can be divided into two major branches differ (Figure 6) Clade i: contains the median fins and fin forms is denoted N1, N2 and. ..N15; Tb1, TB2, TB3...TB15 and Trachinotus ovantus Clade II: includes the long form is denoted D1, D2 and. ..Trachinotus blochii and D15 roads.