Một số tồn tại.
(1) Cạnh tranh cao về giá dịch vụ.
Mức độ tập trung các cảng cao, ước tính có tổng cộng 60 cầu cảng hoạt động trên gần 10km tại sông Cấm, và điều kiện tự nhiên khá tương đồng, làm cho tình hình cạnh tranh về giá cung cấp dịch vụ trở lên gay gắt.
(2) một số doanh nghiệp như Hải An, Viconship, Đình Vũ, Nam Hải trong năm 2014 đã hoạt động vượt công suất thiết kế lần lượt 47%, 15%, 40%, 65%.